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| ==Verfeinerung mit refmac== | | ==Verfeinerung mit refmac== |
| ===Hinzuf?gen eines Liganden zur Bibliothek===
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| Wenn ein neuer Ligand entdeckt wurde, der noch nicht in der Library enthalten ist spuckt refmac folgende Meldung aus:
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| Important, Important, Important!!!!!
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| Your coordinate file has a ligand which has either minimum or no description in the library
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| A new ligand description has been added to /tmp/$username/refmac5_temp1.XXXXXX.lib.cif
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| Picture of the new ligand can be viewed using postscript file. See above
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| Check description in this file and, if satisfied, use it as the input library
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| Otherwise either edit bond orders manually or use CCP4i Sketcher to view and edit the ligand
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| and create a library entry by running libcheck
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| It is strongly recommended that dictionary entry should be checked carefully before using it
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| If you are happy with the library description then use the keyword (MAKE CHECK NONE)
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| I.e. do not check correctness of the coordinates
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| Das File $username/refmac5_temp1.XXXXXX.lib.cif sinnvoll umtaufen, und refmac mit dem Befehl LIBIN ?bergeben.
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| Im gleichen Verzeichnis findet sich auch ein PostScript file, das die Daten des neuen Molek?ls enth?lt.
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| M?gliche Ursachen f?r Fehlermeldungen:
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| *Besetzung = 0
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| *Leerzeichen nach / in der neu hinzugef?gten Zeile LIBIN
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| *...
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| =Nameskonventionen= | | =Nameskonventionen= |
