Difference between revisions of "Bioinformatik"
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*[[HKL2000]] Indexing | |||
*[[SHELX]] Phasing und Refinement für hohe Auflösungen | |||
*[[CCP4]] Indexing, Phasing und Refinement ([[Refmac]]) und alles andere | |||
*[[CNS]] Phasing Refinement | |||
*[[coot]] Visualisierung und Modelling | |||
*[[Pymol]] Visualisierung | |||
*[[USF]] Programmpaket der Uppsala Software Factory | |||
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==Reflexionsfiles== | ==Reflexionsfiles== | ||
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**[[C_alpha-Trace]] | |||
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**[[Hinzufügen eines Liganden zur Bibliothek]] | |||
==Konvertierung== | ==Konvertierung== | ||
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*[[f2mtz]] (Teil von [[CCP4]]) | *[[f2mtz]] (Teil von [[CCP4]]) | ||
Bioinformatik | =Nameskonventionen= | ||
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*data Röntgenrohdaten (Bilder) | |||
*datared (red=reduziert) hkl files | |||
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Latest revision as of 16:27, 12 January 2021
Programme
- XDS Indexing
- HKL2000 Indexing
- SHELX Phasing und Refinement für hohe Auflösungen
- CCP4 Indexing, Phasing und Refinement (Refmac) und alles andere
- CNS Phasing Refinement
- coot Visualisierung und Modelling
- Pymol Visualisierung
- USF Programmpaket der Uppsala Software Factory
Dateiformate
Reflexionsfiles
Strukturfiles
- Pdb Pdb Website
- mmCIF
Dichtefiles
- fcf in SHELX, sollte bald mit coot lesbar sein
Skripten und HowTo
- Pymol
- refmac
Konvertierung
Nameskonventionen
Ordner
- data Röntgenrohdaten (Bilder)
- datared (red=reduziert) hkl files
