Difference between revisions of "Bioinformatik"
From wiki.erlangen.ccc.de
cccer>Tox |
m (34 revisions imported: backup from erlangen.ccc.de @ hydra) |
||
| (One intermediate revision by one other user not shown) | |||
| Line 2: | Line 2: | ||
*[[XDS]] Indexing | *[[XDS]] Indexing | ||
*[[HKL2000]] Indexing | *[[HKL2000]] Indexing | ||
*[[SHELX]] Phasing und Refinement | *[[SHELX]] Phasing und Refinement für hohe Auflösungen | ||
*[[CCP4]] Indexing, Phasing und Refinement ([[Refmac]]) und alles andere | *[[CCP4]] Indexing, Phasing und Refinement ([[Refmac]]) und alles andere | ||
*[[CNS]] Phasing Refinement | *[[CNS]] Phasing Refinement | ||
| Line 27: | Line 27: | ||
**[[Einfache Filme in Pymol]] | **[[Einfache Filme in Pymol]] | ||
*refmac | *refmac | ||
**[[ | **[[Hinzufügen eines Liganden zur Bibliothek]] | ||
==Konvertierung== | ==Konvertierung== | ||
| Line 35: | Line 35: | ||
=Nameskonventionen= | =Nameskonventionen= | ||
==Ordner== | ==Ordner== | ||
*data | *data Röntgenrohdaten (Bilder) | ||
*datared (red=reduziert) hkl files | *datared (red=reduziert) hkl files | ||
[[Kategorie:Bioinformatik]] | [[Kategorie:Bioinformatik]] | ||
Latest revision as of 16:27, 12 January 2021
Programme
- XDS Indexing
- HKL2000 Indexing
- SHELX Phasing und Refinement für hohe Auflösungen
- CCP4 Indexing, Phasing und Refinement (Refmac) und alles andere
- CNS Phasing Refinement
- coot Visualisierung und Modelling
- Pymol Visualisierung
- USF Programmpaket der Uppsala Software Factory
Dateiformate
Reflexionsfiles
Strukturfiles
- Pdb Pdb Website
- mmCIF
Dichtefiles
- fcf in SHELX, sollte bald mit coot lesbar sein
Skripten und HowTo
- Pymol
- refmac
Konvertierung
Nameskonventionen
Ordner
- data Röntgenrohdaten (Bilder)
- datared (red=reduziert) hkl files
