Difference between revisions of "Bioinformatik"
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*[[CCP4]] Indexing, Phasing und Refinement ([[Refmac]]) und alles andere | |||
*[[CNS]] Phasing Refinement | |||
*[[coot]] Visualisierung und Modelling | |||
*[[Pymol]] Visualisierung | |||
*[[USF]] Programmpaket der Uppsala Software Factory | |||
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**[[C_alpha-Trace]] | **[[C_alpha-Trace]] | ||
**[[Einfache Filme in Pymol]] | |||
*refmac | *refmac | ||
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==Konvertierung== | ==Konvertierung== | ||
*XDSCONF (Teil von [[XDS]]) | *XDSCONF (Teil von [[XDS]]) | ||
*[[f2mtz]] (Teil von [[CCP4]]) | *[[f2mtz]] (Teil von [[CCP4]]) | ||
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==Ordner== | ==Ordner== | ||
*data | *data Röntgenrohdaten (Bilder) | ||
*datared (red=reduziert) hkl files | *datared (red=reduziert) hkl files | ||
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Latest revision as of 16:27, 12 January 2021
Programme
- XDS Indexing
- HKL2000 Indexing
- SHELX Phasing und Refinement für hohe Auflösungen
- CCP4 Indexing, Phasing und Refinement (Refmac) und alles andere
- CNS Phasing Refinement
- coot Visualisierung und Modelling
- Pymol Visualisierung
- USF Programmpaket der Uppsala Software Factory
Dateiformate
Reflexionsfiles
Strukturfiles
- Pdb Pdb Website
- mmCIF
Dichtefiles
- fcf in SHELX, sollte bald mit coot lesbar sein
Skripten und HowTo
- Pymol
- refmac
Konvertierung
Nameskonventionen
Ordner
- data Röntgenrohdaten (Bilder)
- datared (red=reduziert) hkl files